66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0726 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  91.63 
 
 
232 aa  427  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  42.92 
 
 
210 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  37.38 
 
 
223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  37.09 
 
 
219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  35.94 
 
 
217 aa  143  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  38.83 
 
 
196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  35.65 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  35.65 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  38.25 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  37.02 
 
 
288 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  33.18 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  32.87 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  31.48 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  32.54 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  30 
 
 
223 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  32.21 
 
 
244 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  30.58 
 
 
242 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  30.58 
 
 
242 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  31.37 
 
 
245 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.96 
 
 
228 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  30.88 
 
 
242 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  29.82 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  30.19 
 
 
240 aa  95.9  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  29.44 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  30.37 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.27 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  27.67 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.18 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  27.88 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  29.52 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  31.53 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  28.71 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  26.05 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  29.13 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  25.45 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  26.99 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  28.85 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  27.75 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  26.22 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  29.21 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  26.57 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  25.98 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  26.73 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  26.63 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  26.13 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  25 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  25.23 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  25.46 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  30.07 
 
 
572 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  25.45 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  25.48 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  24.8 
 
 
652 aa  62  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  25.76 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  26.7 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  26.67 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  25.49 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  28.99 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.99 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  26.11 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  26.19 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  26.19 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  26.51 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1538  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  24.87 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0513881 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  24.78 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  23.62 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>