112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43636 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  100 
 
 		 652 aa  1342    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  29.07 
 
 		 1685 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  48.26 
 
 		 227 aa  200  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  44.93 
 
 		 215 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  39.81 
 
 		 669 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  35.06 
 
 		 221 aa  126  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  34.07 
 
 		 223 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  34.07 
 
 		 223 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  34.07 
 
 		 223 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  30.91 
 
 		 241 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  32.35 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  30.86 
 
 		 235 aa  117  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  30.14 
 
 		 242 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  32.89 
 
 		 222 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  29.22 
 
 		 245 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  31.14 
 
 		 231 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  32.88 
 
 		 218 aa  110  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  31.6 
 
 		 258 aa  108  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  30.53 
 
 		 229 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  31.96 
 
 		 241 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  30.22 
 
 		 222 aa  103  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  27.85 
 
 		 238 aa  103  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  31.82 
 
 		 238 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  30.09 
 
 		 225 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  30.91 
 
 		 232 aa  98.6  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  31.34 
 
 		 244 aa  99  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  31.08 
 
 		 226 aa  97.8  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  30.08 
 
 		 226 aa  97.1  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  29.6 
 
 		 222 aa  92.8  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  29.46 
 
 		 229 aa  92  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  28.39 
 
 		 218 aa  90.9  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  28.7 
 
 		 234 aa  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  26.46 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  26.01 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  25.69 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  28.03 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  28.92 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  24.51 
 
 		 242 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  24.51 
 
 		 242 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  27.95 
 
 		 217 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  24.8 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  26.29 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  27.06 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  27.06 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  22.18 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  31.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  32.99 
 
 		 222 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  23.98 
 
 		 244 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 140 aa  55.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  24.79 
 
 		 223 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  25.97 
 
 		 240 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.65 
 
 		 132 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 127 aa  52  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.71 
 
 		 196 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  32.2 
 
 		 128 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 124 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 129 aa  50.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  31.97 
 
 		 129 aa  50.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  32.26 
 
 		 128 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  32.26 
 
 		 128 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  22.22 
 
 		 288 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.72 
 
 		 126 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  24.66 
 
 		 223 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 127 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  31.97 
 
 		 128 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  22.67 
 
 		 274 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 125 aa  48.5  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  23.64 
 
 		 222 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  28.81 
 
 		 126 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 128 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  31.3 
 
 		 213 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 128 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  28.06 
 
 		 127 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  19.82 
 
 		 245 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  32.1 
 
 		 130 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 128 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 125 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  29.51 
 
 		 127 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  31.65 
 
 		 126 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  19.82 
 
 		 248 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 128 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  30.33 
 
 		 126 aa  45.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 125 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 125 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  30.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  30.86 
 
 		 130 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  28.46 
 
 		 127 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 128 aa  45.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  32.1 
 
 		 130 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 128 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 227 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  30.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  32.1 
 
 		 144 aa  44.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>