57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0164 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  70.09 
 
 
235 aa  323  1e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  70.59 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  62.28 
 
 
244 aa  286  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  34.65 
 
 
224 aa  158  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  35.82 
 
 
231 aa  156  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  39.3 
 
 
222 aa  155  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  35.4 
 
 
223 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  36.04 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  35.24 
 
 
223 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  34.8 
 
 
223 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  39.65 
 
 
223 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  35.35 
 
 
222 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  38.07 
 
 
226 aa  141  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  35.71 
 
 
234 aa  139  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  33.33 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  33.66 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  31.68 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  37.22 
 
 
229 aa  129  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  34.36 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  32.43 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  33.16 
 
 
218 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  33.05 
 
 
238 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  32.29 
 
 
218 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  33.03 
 
 
242 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  30.91 
 
 
652 aa  98.6  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  32.74 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  33 
 
 
241 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  35.12 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  34.39 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  31.05 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  30.89 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.89 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  24.88 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  24.88 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  29.58 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  26.13 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  27.41 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  24.68 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  24.68 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1538  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  34.98 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0513881 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  23.95 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  24.88 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  26.13 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  24.52 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  25 
 
 
1685 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  34.56 
 
 
669 aa  53.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  23.88 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30 
 
 
228 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  23.39 
 
 
244 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  23.74 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.65 
 
 
224 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  25.62 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  24.75 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  21.78 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  24.75 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  20.79 
 
 
274 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>