28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1538 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1538  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0513881 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  53.47 
 
 
201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  52.48 
 
 
201 aa  207  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  34.98 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  32.58 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  29.32 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  25.91 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  29.84 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  29.84 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  32.81 
 
 
235 aa  61.6  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  28.27 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  30.18 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  34.04 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  31.03 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  25.4 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  27.96 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  23.28 
 
 
232 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  26.88 
 
 
223 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  28.5 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  26.99 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  28.88 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  28.35 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  25.52 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  30 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  27.66 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  24.35 
 
 
226 aa  41.6  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  24.29 
 
 
222 aa  41.6  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  23.66 
 
 
221 aa  41.2  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>