53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1736 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  67.12 
 
 
222 aa  317  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  57.08 
 
 
234 aa  265  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  47.3 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  45.54 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  45.54 
 
 
223 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  44.55 
 
 
222 aa  167  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  45.05 
 
 
223 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  45.05 
 
 
223 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  42.79 
 
 
258 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  41.29 
 
 
235 aa  159  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  37.39 
 
 
229 aa  158  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  41.46 
 
 
226 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  39.3 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  40.1 
 
 
221 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  42.79 
 
 
244 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  38.81 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  39.9 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  36.07 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  37.56 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  36.63 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  32.2 
 
 
218 aa  108  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  30.66 
 
 
242 aa  101  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  31.98 
 
 
218 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  29.6 
 
 
652 aa  93.2  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  29.19 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  28.3 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  29.65 
 
 
245 aa  92  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  34.18 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  28.95 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  30.22 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  27.86 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  33 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  31.53 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  30.2 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  30.2 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  26.79 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  26.79 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  28.64 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  31.71 
 
 
669 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  27.59 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  26.24 
 
 
288 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  24.88 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  28.71 
 
 
210 aa  58.5  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  25.98 
 
 
242 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  25.98 
 
 
242 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  26.44 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  25.13 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  25.47 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  30.59 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  22.28 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  23.85 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  23.44 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>