63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1107 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  100 
 
 
229 aa  460  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  60.62 
 
 
226 aa  278  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  53.54 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  55.26 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  48.66 
 
 
225 aa  235  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  44.83 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  43.17 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  42.73 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  42.29 
 
 
223 aa  181  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  41.85 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  41.23 
 
 
223 aa  168  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  38.86 
 
 
224 aa  162  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  35.4 
 
 
229 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  42.04 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  41.38 
 
 
222 aa  155  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  40 
 
 
234 aa  153  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  40.52 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  35.15 
 
 
221 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  40.09 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  39.32 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  36.07 
 
 
222 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  36.16 
 
 
244 aa  134  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  37.22 
 
 
232 aa  129  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  37.5 
 
 
242 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  40.09 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  38.2 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  36.23 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  35.75 
 
 
218 aa  118  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  30.53 
 
 
652 aa  105  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  33.33 
 
 
227 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  28.31 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  28.31 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  30.77 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  30.7 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  30.7 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  28.95 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  30.34 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  29.81 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  28.18 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  29.52 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  28.18 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  29.11 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  28.86 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  28.84 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  32.21 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  32.32 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  26.79 
 
 
244 aa  72  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  26.15 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  31.1 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  32.12 
 
 
669 aa  65.9  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  23.94 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  24.52 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  25.11 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  23.15 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  26.95 
 
 
572 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  25.38 
 
 
1685 aa  52.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  25.39 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.57 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  28.04 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  23.41 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  20.49 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.96 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>