43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5702 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  100 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  48.26 
 
 
652 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  44.85 
 
 
215 aa  132  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  35.24 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  34.52 
 
 
1685 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  45.71 
 
 
669 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  31.56 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  34.2 
 
 
226 aa  106  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  31.7 
 
 
223 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  31.7 
 
 
223 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  31.7 
 
 
223 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  33.78 
 
 
245 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  29.82 
 
 
224 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  32.44 
 
 
226 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  34.38 
 
 
241 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  33.33 
 
 
229 aa  99  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  31.3 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  32.88 
 
 
235 aa  96.7  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  31.58 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  33.03 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  32.89 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  29.2 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  30.36 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  33.93 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  26.52 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  33.94 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  29.96 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  30.04 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  31.02 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  30.22 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  27.68 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  29.6 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  31.05 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  27.68 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  31.19 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  32.98 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  24.78 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  26.11 
 
 
232 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  24.34 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  24.23 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  24.23 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>