64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0609 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  98.65 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  98.2 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  86.49 
 
 		 222 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  83.93 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  44.59 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  43.42 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  43.06 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  43.17 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  41.85 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  44.12 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  44.55 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  41.78 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  40.95 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  45.54 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  39.91 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  40.52 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  37.78 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  38.84 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  40.43 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  39.41 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  37.5 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  38.33 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  35.4 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  37.77 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  37.66 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  38.89 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  38.27 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  34.07 
 
 		 652 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  31.7 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  33.33 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  29.61 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  29.61 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  29.36 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  27.67 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  29.61 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  27.98 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  25 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  26.19 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  23.33 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  27 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  30.81 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  30.81 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  29.13 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  26.73 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  26.85 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  28.16 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  27.5 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  27.75 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.51 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  32.17 
 
 		 669 aa  60.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  25.12 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.98 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  29.65 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  25.96 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1538  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  30.37 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0513881 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  26.97 
 
 		 572 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.98 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  23.26 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  25.24 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  25.37 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  21.55 
 
 		 1685 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>