69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02960 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
669 aa  1340    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  29.58 
 
 
652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  42.46 
 
 
215 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  29.05 
 
 
1685 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  45.71 
 
 
227 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  32.93 
 
 
231 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  39.84 
 
 
221 aa  84  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  37.06 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  40.18 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  38.1 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  34.56 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  32.88 
 
 
224 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  36.69 
 
 
241 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  35.66 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  35.66 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  40.14 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  32.12 
 
 
229 aa  73.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  31.71 
 
 
222 aa  73.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  31.43 
 
 
229 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  32.17 
 
 
223 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  31.13 
 
 
234 aa  72.4  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  31.47 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  31.47 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  39.09 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  31.52 
 
 
222 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  31.88 
 
 
226 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  30.94 
 
 
238 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  42.55 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  34.07 
 
 
238 aa  68.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  33.33 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  35.4 
 
 
218 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  31.39 
 
 
226 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  34.81 
 
 
242 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  33.04 
 
 
225 aa  64.3  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  30.66 
 
 
258 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  34.35 
 
 
232 aa  61.6  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  26.77 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  31.11 
 
 
244 aa  57  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  26.26 
 
 
250 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  29.75 
 
 
217 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  29.75 
 
 
217 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 
127 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  27.78 
 
 
248 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  26.85 
 
 
288 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  26.83 
 
 
572 aa  48.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  25 
 
 
245 aa  47.8  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  66.67 
 
 
127 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  31.82 
 
 
222 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 
127 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 
129 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  28.8 
 
 
223 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 
127 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 
127 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 
127 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 
127 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 
127 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  24.35 
 
 
240 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.57 
 
 
140 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  60.61 
 
 
151 aa  45.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  60.61 
 
 
151 aa  45.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
127 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
127 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 
126 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  54.55 
 
 
127 aa  44.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
128 aa  44.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
127 aa  43.9  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
129 aa  43.9  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  60.61 
 
 
128 aa  43.9  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>