73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1853 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  100 
 
 		 222 aa  458  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  42.36 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  35.68 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  38.39 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  32.87 
 
 		 274 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  35.59 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  38.94 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  35.47 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  40.4 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  38.28 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  34.34 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  36.84 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  36.74 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  32.7 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  30.1 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  36.45 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  30.77 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  30.54 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  30.32 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  33.66 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  31.25 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  31.25 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  32.84 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  31.5 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  32.84 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  30.2 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  29.58 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  30.37 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.38 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  29.21 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  28.71 
 
 		 245 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  27.09 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  24.88 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  26.34 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  26.44 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  25.56 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  26.98 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  26.29 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  26.87 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  27.59 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  25.48 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  27.18 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  28.14 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  30.52 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  23.98 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  23.04 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  25.49 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  24.18 
 
 		 572 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  26.24 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  26.92 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  24.52 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  25.58 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  23.26 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  23.44 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  23.72 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  23.72 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  25 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  27.1 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  25.12 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  28.77 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  35.94 
 
 		 101 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  23.53 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.74 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  28.49 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  23.64 
 
 		 652 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.04 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  30.56 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  24.75 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  24.11 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  24.11 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  24.11 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  24.11 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  24.11 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>