More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0676 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  100 
 
 
347 aa  692    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  66.28 
 
 
344 aa  432  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  66.02 
 
 
376 aa  418  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.1 
 
 
368 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  55.92 
 
 
369 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  57.68 
 
 
350 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  57.68 
 
 
356 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  57.1 
 
 
345 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  56.77 
 
 
347 aa  333  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.01 
 
 
426 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.51 
 
 
338 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.06 
 
 
337 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.42 
 
 
338 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  52.19 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.16 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  54.23 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  48.83 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.71 
 
 
340 aa  272  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.13 
 
 
346 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  43.9 
 
 
353 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  48.71 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.35 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  45.8 
 
 
402 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.21 
 
 
338 aa  268  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  44.86 
 
 
407 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.06 
 
 
343 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  44.22 
 
 
394 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  44.38 
 
 
407 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  45.99 
 
 
428 aa  266  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.82 
 
 
354 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.82 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  47.62 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.47 
 
 
354 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.36 
 
 
408 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.36 
 
 
408 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  45.27 
 
 
397 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  50.69 
 
 
334 aa  265  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  44 
 
 
407 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  47.69 
 
 
338 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  47.37 
 
 
327 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  47.7 
 
 
408 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  48.64 
 
 
357 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  48 
 
 
357 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.95 
 
 
338 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  43.8 
 
 
408 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  45.04 
 
 
346 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.22 
 
 
369 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.83 
 
 
333 aa  259  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  52.82 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.38 
 
 
429 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  52.82 
 
 
339 aa  258  9e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.68 
 
 
434 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  43.47 
 
 
354 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.32 
 
 
347 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  45.19 
 
 
332 aa  257  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  44.73 
 
 
353 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.03 
 
 
370 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  45.64 
 
 
352 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.56 
 
 
425 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  49.15 
 
 
382 aa  255  9e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  44.32 
 
 
341 aa  255  9e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  43.35 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  49.82 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  46.94 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.88 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  51.23 
 
 
423 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  44.67 
 
 
428 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.35 
 
 
440 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  44.96 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.14 
 
 
406 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  45.3 
 
 
355 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  46.9 
 
 
338 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  49.3 
 
 
406 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  44.44 
 
 
372 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  43.75 
 
 
341 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  44.96 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  44.96 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  44.96 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  51.16 
 
 
435 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  44.96 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  44.96 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  51.16 
 
 
435 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  44.96 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  45.1 
 
 
358 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.07 
 
 
439 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.28 
 
 
348 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  50 
 
 
356 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.95 
 
 
406 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  47.11 
 
 
424 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  47.47 
 
 
350 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  42.74 
 
 
397 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.32 
 
 
350 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.53 
 
 
417 aa  249  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  49.5 
 
 
338 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.3 
 
 
415 aa  248  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  48.25 
 
 
337 aa  248  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.42 
 
 
438 aa  248  9e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.16 
 
 
396 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  44.22 
 
 
430 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  43.39 
 
 
345 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>