216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0096 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
349 aa  687    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0782  flagellar basal body P-ring protein  67.05 
 
 
352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1031  flagellar basal body P-ring protein  65.62 
 
 
350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0715097  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1143  flagellar P-ring protein  60.62 
 
 
350 aa  412  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1636  flagellar basal body P-ring protein  59.3 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1810  flagellar basal body P-ring protein  59.3 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1455  flagellar basal body P-ring protein  59.3 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0400  flagellar basal body P-ring protein  57.22 
 
 
348 aa  393  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.574855  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0562  flagellar basal body P-ring protein  53.95 
 
 
351 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  45.11 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  43.96 
 
 
363 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  43.35 
 
 
398 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
364 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  43.77 
 
 
365 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  43.93 
 
 
371 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  42.77 
 
 
398 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  43.6 
 
 
368 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  39.66 
 
 
370 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  40.27 
 
 
369 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  40.05 
 
 
363 aa  248  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  41.08 
 
 
374 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  41.89 
 
 
367 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  40.82 
 
 
370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 
386 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  40.49 
 
 
363 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  39.71 
 
 
371 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  41.79 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  42.44 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  38.9 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  40.97 
 
 
377 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  38.98 
 
 
369 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  41.5 
 
 
373 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  40.8 
 
 
373 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
351 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  39.89 
 
 
377 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  37.2 
 
 
371 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  41.29 
 
 
391 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  41.29 
 
 
391 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  42.3 
 
 
391 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  42.3 
 
 
394 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  41.09 
 
 
376 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  41.42 
 
 
390 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  40.17 
 
 
383 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  42.42 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  42.02 
 
 
392 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  42.02 
 
 
392 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  40.87 
 
 
378 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  39.07 
 
 
380 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  41.28 
 
 
374 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  39.07 
 
 
380 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  39.71 
 
 
377 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  39.42 
 
 
371 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  40.62 
 
 
361 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  41.57 
 
 
401 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  41.57 
 
 
397 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  41.57 
 
 
401 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  41.57 
 
 
400 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  41.57 
 
 
400 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  41.57 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  41.57 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  39.72 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  40.34 
 
 
362 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  40.16 
 
 
366 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  40.98 
 
 
365 aa  232  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  38.4 
 
 
367 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  39.77 
 
 
401 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0591  flagellar P-ring protein  42.06 
 
 
342 aa  232  9e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000860918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  39.59 
 
 
370 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  40.32 
 
 
372 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  40.22 
 
 
386 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  38.61 
 
 
367 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  40.8 
 
 
369 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  40.8 
 
 
369 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  39.01 
 
 
369 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  39.01 
 
 
369 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  40.56 
 
 
373 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  38.92 
 
 
368 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  38.69 
 
 
369 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  40.12 
 
 
376 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2267  flagellar basal body P-ring protein  41.5 
 
 
383 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  40.16 
 
 
363 aa  228  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0843  flagellar basal body P-ring protein  41.01 
 
 
333 aa  228  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56435  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  42 
 
 
369 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  37.84 
 
 
370 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  40.4 
 
 
374 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  37.6 
 
 
365 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  40.44 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  39.13 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  38.87 
 
 
357 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  40.22 
 
 
395 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 
369 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  38.87 
 
 
413 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  39.37 
 
 
380 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 
383 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  38.74 
 
 
371 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  38.14 
 
 
371 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  39.4 
 
 
364 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  38.36 
 
 
367 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1532  flagellar basal body P-ring protein  40.6 
 
 
369 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.760833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  37.57 
 
 
371 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>