More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1381 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  67.26 
 
 		 223 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  63.3 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.26 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  61.26 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.81 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  61.26 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  61.26 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  61.26 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.26 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  60.81 
 
 		 227 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  60.81 
 
 		 227 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  60.81 
 
 		 227 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  60.81 
 
 		 226 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.91 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.15 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.44 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  60.81 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.8 
 
 		 225 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.81 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  62.84 
 
 		 224 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.81 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.35 
 
 		 225 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.35 
 
 		 225 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.81 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.81 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.35 
 
 		 225 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 225 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.8 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  60.09 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.91 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.01 
 
 		 227 aa  274  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.82 
 
 		 226 aa  274  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3374  heavy metal response regulator  62.44 
 
 		 229 aa  274  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 		 226 aa  274  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.54 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.81 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3603  DNA-binding heavy metal response regulator  61.99 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203952  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.54 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.09 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  63.51 
 
 		 228 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.99 
 
 		 226 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.82 
 
 		 219 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  57.01 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  60.55 
 
 		 223 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.09 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  56.56 
 
 		 224 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  59.91 
 
 		 223 aa  267  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.46 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 223 aa  266  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.82 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4465  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.41 
 
 		 206 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0436659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 		 223 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6111  regulator protein CopR  61.71 
 
 		 228 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.23 
 
 		 226 aa  264  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  58.56 
 
 		 226 aa  264  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5607  two-component response regulator  62.44 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64570  two-component response regulator  62.44 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1742  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.81 
 
 		 228 aa  261  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.92 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.67 
 
 		 227 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.02 
 
 		 232 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 223 aa  259  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.56 
 
 		 226 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  57.92 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.92 
 
 		 227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.05 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.92 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.56 
 
 		 226 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.92 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.61 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.92 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 225 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.47 
 
 		 228 aa  256  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.47 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.01 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.08 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.11 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  55.8 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  60 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.8 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.8 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.47 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.8 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.61 
 
 		 226 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.66 
 
 		 223 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.56 
 
 		 223 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.56 
 
 		 223 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  56.76 
 
 		 226 aa  254  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  56.76 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.76 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  56.11 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>