270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2141 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  100 
 
 
298 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  67.93 
 
 
301 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  61.72 
 
 
301 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  58.28 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  45.39 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.75 
 
 
287 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.6 
 
 
293 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.58 
 
 
305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.92 
 
 
305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.92 
 
 
305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  37.46 
 
 
299 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01300  2,4-dichlorophenoxyacetate alpha-ketoglutarate dioxygenase, putative  34.11 
 
 
312 aa  148  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.46547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  32.76 
 
 
285 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  32.87 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  34.88 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  35.52 
 
 
308 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.88 
 
 
294 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  32.75 
 
 
298 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  34.48 
 
 
304 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  35.79 
 
 
296 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  34.95 
 
 
308 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  34.95 
 
 
308 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  33.83 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  33.83 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.07 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  34.16 
 
 
302 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  34.26 
 
 
308 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  34.26 
 
 
308 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  31.47 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.76 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  32.96 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  34.26 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  34.31 
 
 
295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.99 
 
 
278 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
305 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  32.75 
 
 
301 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  33.91 
 
 
273 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.78 
 
 
278 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  32.89 
 
 
280 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  30.45 
 
 
299 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  32.87 
 
 
291 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  30.77 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  32.13 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  32.13 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  32.13 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  32.13 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  32.13 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  32.13 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  31.34 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  32.06 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  31.69 
 
 
300 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2472  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.6 
 
 
281 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252364  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  31.08 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  31.08 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.03 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  31.08 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.45 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  31.08 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  31.08 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  31.08 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  31.08 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  31.23 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  31.08 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  29.45 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  31.47 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  31.31 
 
 
277 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.54 
 
 
281 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2971  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.42 
 
 
281 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  32.19 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  31.16 
 
 
277 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  31.51 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  31.47 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.74 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  30.54 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  30.48 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  31.01 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  30.07 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  31.47 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.54 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  30.98 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  29.41 
 
 
307 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  29.34 
 
 
281 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3374  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.38 
 
 
281 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3721  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.56 
 
 
281 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  31.76 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.25 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3781  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.56 
 
 
281 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485514  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  29.39 
 
 
283 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.07 
 
 
275 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  28.98 
 
 
282 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3708  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.56 
 
 
281 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  31.96 
 
 
304 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  27.46 
 
 
271 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
282 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  30.46 
 
 
315 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  31.58 
 
 
277 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  29.32 
 
 
282 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  31.23 
 
 
335 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>