40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1757 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  100 
 
 		 384 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  88.95 
 
 		 389 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  78.7 
 
 		 386 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  71.8 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0451  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  71.5 
 
 		 385 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4199  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  62.86 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3316  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  62.08 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4850  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  62.08 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.97 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.48 
 
 		 304 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.18 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.62 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.34 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.6 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.69 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.74 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  27.48 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.04 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.78 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0099  pilx6 protein  25 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0519524  normal  0.478 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  22.44 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623118 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.5 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  25.2 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  25.2 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  22.66 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5415  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.05 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5010  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.05 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0449  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.09 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124171  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.08 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2658  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.09 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0260661  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7349  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.23 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.149767 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08210  conjugal transfer protein TraA  25.9 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0038  putative conjugal transfer protein  27.86 
 
 		 350 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  22.93 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0039  TriE protein  22.55 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2439  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.72 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589519 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0862  type IV secretion system protein VirB6  30.38 
 
 		 873 aa  43.9  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  21.22 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0857  type IV secretion system protein VirB6  28.57 
 
 		 851 aa  43.9  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.18 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.83662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>