10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_5010 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_5010  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 338 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5415  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 338 aa  678    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4750  hypothetical protein  23.37 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5231  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.67 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00626423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.59 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  31.82 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  29.05 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2823  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.17 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6307  hypothetical protein  29.51 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.53 
 
 		 386 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>