More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3833 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
324 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  73.6 
 
 
323 aa  497  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.24 
 
 
323 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  72.36 
 
 
323 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  73.33 
 
 
323 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.95 
 
 
331 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.07 
 
 
331 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.64 
 
 
332 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.32 
 
 
325 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.55 
 
 
332 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.64 
 
 
325 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.63 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.84 
 
 
326 aa  401  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.54 
 
 
329 aa  401  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.16 
 
 
334 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.21 
 
 
326 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  61.69 
 
 
324 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.56 
 
 
327 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.81 
 
 
335 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.94 
 
 
325 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.81 
 
 
324 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.42 
 
 
332 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.42 
 
 
332 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.42 
 
 
332 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.49 
 
 
324 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.55 
 
 
325 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.08 
 
 
339 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.03 
 
 
328 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.81 
 
 
328 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.92 
 
 
328 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  60.58 
 
 
328 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.09 
 
 
330 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.13 
 
 
324 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.49 
 
 
324 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.62 
 
 
328 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.63 
 
 
328 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.73 
 
 
330 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.63 
 
 
325 aa  349  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  56.91 
 
 
334 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.63 
 
 
327 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.85 
 
 
324 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  51.77 
 
 
340 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  52.41 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  52.47 
 
 
269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.83 
 
 
319 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.95 
 
 
319 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.94 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  40.06 
 
 
314 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.82 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.68 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.64 
 
 
323 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.12 
 
 
309 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.39 
 
 
311 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  36.2 
 
 
278 aa  205  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.38 
 
 
314 aa  205  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  41.5 
 
 
321 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.9 
 
 
316 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.56 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.54 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  38.85 
 
 
317 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.49 
 
 
319 aa  195  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.25 
 
 
319 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.57 
 
 
316 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  36.51 
 
 
311 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  37.82 
 
 
321 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.26 
 
 
342 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.98 
 
 
313 aa  185  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.29 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.89 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.04 
 
 
312 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.21 
 
 
315 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.49 
 
 
316 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.66 
 
 
325 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.17 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.54 
 
 
311 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.25 
 
 
316 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.75 
 
 
313 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.94 
 
 
314 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.94 
 
 
314 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.5 
 
 
323 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  35.55 
 
 
318 aa  165  8e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.65 
 
 
305 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.4 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.33 
 
 
355 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2734  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.39 
 
 
319 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.11 
 
 
380 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.38 
 
 
315 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.38 
 
 
369 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.44 
 
 
330 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.09 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.51 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.71 
 
 
338 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.8 
 
 
353 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  34.11 
 
 
361 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.23 
 
 
314 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.74 
 
 
326 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.82 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.44 
 
 
326 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.18 
 
 
356 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.61 
 
 
356 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>