229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2924 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  60.64 
 
 		 250 aa  314  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  59.36 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  58.7 
 
 		 251 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  58.87 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  58.4 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  56.4 
 
 		 273 aa  294  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  57.79 
 
 		 267 aa  294  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  60 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  58.7 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  55.2 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  57.89 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  55.92 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  57.83 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  56.33 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  55.78 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  57.72 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.51 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  54.18 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  54.18 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  53.2 
 
 		 250 aa  274  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  53.39 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  55.1 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.55 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.14 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  54.92 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.2 
 
 		 254 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  56.07 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  55.51 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  49.18 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  54.18 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  54.18 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  54.18 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  48.77 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  48.77 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.8 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.82 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  49.59 
 
 		 255 aa  238  9e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  47.6 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  56.52 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  52.12 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 		 402 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.28 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  48.19 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  47.95 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  41.22 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  48.36 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  48.37 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  42.45 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  41.8 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  40.41 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  58.21 
 
 		 137 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  38.93 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.1 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  37.4 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  38.21 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  36.73 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  36.89 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.94 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.91 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  32.27 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.8 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.6 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  31.84 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.42 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  30.09 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  31.94 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  32.87 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  29.57 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  35.21 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.21 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.38 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.26 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  27.47 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  22.71 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.46 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.65 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 309 aa  62  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.34 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>