46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1857 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  55.15 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  48.53 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  43.38 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  39.71 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  35.51 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  42.11 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3400  hypothetical protein  34.06 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2611  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0233173  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  35.66 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6675  protein of unknown function UPF0150  33.58 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1448  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1336  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2724  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  29.93 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  35.82 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1114  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.463987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0560  protein of unknown function UPF0150  33.64 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  38.71 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  34.44 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  31.86 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  40.79 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  30.23 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  26.36 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  34.57 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  33.85 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1294  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.289412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  30.23 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0150  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  37.25 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  33.9 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 142 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>