More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1847 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  100 
 
 
113 aa  219  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.095489999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  54.08 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  48.15 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
108 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 
112 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  43.86 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
101 aa  86.7  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  45.28 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  48.45 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.17 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  45.28 
 
 
112 aa  83.6  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  45 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  48.45 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  48.45 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  42.72 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  45 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  42.16 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  47.47 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  41.75 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  39.29 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  45.19 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  42.27 
 
 
101 aa  76.6  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  45.63 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  42.2 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  46.67 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  46.6 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  49.02 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  42.72 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>