More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5776 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  100 
 
 		 118 aa  235  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  68.93 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  53.1 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  47.47 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  49 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  42.31 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  48 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0215  50S ribosomal protein L24  57.75 
 
 		 92 aa  91.3  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  43.86 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.095489999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  41.9 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  40.38 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  39.25 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  43 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  39.6 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  41 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  38 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  41.49 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  41.35 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  39 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  39 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  42.05 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  39.22 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  39.22 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  38 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  41 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  41 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  39.25 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  39.09 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  39.22 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  38.64 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  37.86 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  37.62 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  39.22 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0495  50S ribosomal protein L24  37.25 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  37.86 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  37.5 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0500  50S ribosomal protein L24  37.25 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000146538  decreased coverage  0.00101346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  39 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  41 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  37.86 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  37.25 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  37.5 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  38 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  38 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  42 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  38 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3994  ribosomal protein L24  39.81 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  49.35 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  38.2 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  38.24 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  36.54 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>