90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6004 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  69.84 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  73.04 
 
 		 113 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  66.13 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  57.26 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  55.34 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  57.14 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  50 
 
 		 98 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  61.9 
 
 		 99 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  52.58 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  58.02 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  51.61 
 
 		 99 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  43 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  54.08 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  44.9 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  48.39 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  55.71 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  41.05 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  56.82 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  53.06 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  53.06 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  46.07 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  43.18 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  43.04 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.29 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  39.47 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  53.52 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.43 
 
 		 591 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  41.89 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  41.89 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  59.18 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  33.67 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.5 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.29 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  41.77 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.97 
 
 		 452 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 983 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 		 429 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 		 429 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 984 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  43.53 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  47.54 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 		 960 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.91 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  42.05 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.04 
 
 		 452 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  44.44 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  30.85 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.85 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  30.85 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  39.78 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.18 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  45.33 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  30.21 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  36.36 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  44.87 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  34.85 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  29.79 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  57.14 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  28.12 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  44 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  29.21 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  38.36 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  31.51 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.71 
 
 		 959 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  32.91 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  32.91 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.56 
 
 		 952 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  32.91 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  30.11 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  31.65 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  39.39 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.96 
 
 		 833 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.74 
 
 		 960 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 		 953 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.74 
 
 		 960 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  36.25 
 
 		 582 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 959 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.88 
 
 		 823 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.56 
 
 		 960 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  31.88 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  35 
 
 		 582 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.68 
 
 		 960 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  30.1 
 
 		 112 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  37.25 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>