More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0151 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 319 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  75.08 
 
 		 317 aa  484  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  75.58 
 
 		 314 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  74.26 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  72.85 
 
 		 316 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  72.19 
 
 		 316 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  72.19 
 
 		 330 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  71.15 
 
 		 309 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  71.9 
 
 		 326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  69.97 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  67.97 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  67.66 
 
 		 328 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  66.99 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  67.99 
 
 		 308 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  66.88 
 
 		 310 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  67.66 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  65.47 
 
 		 313 aa  417  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  64.78 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  64.45 
 
 		 312 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  64.45 
 
 		 312 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  63.91 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  61.72 
 
 		 304 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  61.92 
 
 		 303 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  61.11 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  62.58 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  56.03 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  60.73 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  56.03 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  54.72 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 		 310 aa  361  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  57.01 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 		 308 aa  354  8.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 		 308 aa  352  7e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 331 aa  348  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  55.19 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  55.74 
 
 		 311 aa  335  7e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  53.38 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  52.86 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 305 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  50.81 
 
 		 303 aa  318  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  53.2 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  50.82 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 		 309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 		 307 aa  305  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  50.51 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 		 308 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 		 303 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 		 321 aa  298  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 		 303 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48.66 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.1 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 		 305 aa  291  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 300 aa  291  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 		 303 aa  291  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  47.81 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  47.47 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 		 313 aa  288  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>