More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5562 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  100 
 
 
196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  97.96 
 
 
196 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  96.94 
 
 
196 aa  393  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  97.45 
 
 
196 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  97.45 
 
 
196 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  97.96 
 
 
196 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  93.88 
 
 
196 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  87.24 
 
 
196 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  87.24 
 
 
196 aa  361  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  87.24 
 
 
196 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  87.24 
 
 
196 aa  361  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  87.24 
 
 
196 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  87.24 
 
 
196 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  87.24 
 
 
196 aa  360  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  86.73 
 
 
196 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  83.25 
 
 
194 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  82.2 
 
 
194 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 
196 aa  318  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  70.43 
 
 
205 aa  272  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  67.2 
 
 
203 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 
203 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  65.76 
 
 
204 aa  260  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  67.03 
 
 
211 aa  256  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  60.32 
 
 
204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  58.92 
 
 
200 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 
204 aa  228  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  55.43 
 
 
199 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  52.15 
 
 
207 aa  204  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  52.36 
 
 
199 aa  204  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  50.27 
 
 
185 aa  192  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 
199 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  47.8 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  46.07 
 
 
180 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 
189 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  47.88 
 
 
177 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 
180 aa  151  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
177 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 
176 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
180 aa  131  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 
176 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  36.99 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
180 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
177 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
184 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
179 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  36.99 
 
 
176 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
186 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
178 aa  122  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
186 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
179 aa  121  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 
179 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 
179 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.78 
 
 
179 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.78 
 
 
179 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 
179 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 
179 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  36.21 
 
 
179 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 
179 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
179 aa  117  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35.88 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  37.04 
 
 
171 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  34.81 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  34.18 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
172 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.53 
 
 
214 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
179 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
175 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
171 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
208 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
176 aa  101  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
189 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
186 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
215 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
175 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  34.91 
 
 
176 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  34.32 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  35.8 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
176 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
186 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>