53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1429 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
473 aa  978    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  59.45 
 
 
496 aa  580  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  38.88 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  33.76 
 
 
462 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  35.33 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  36.66 
 
 
474 aa  263  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  34.32 
 
 
464 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  35.56 
 
 
460 aa  257  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  33.8 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  32.9 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  35.41 
 
 
464 aa  254  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  33.55 
 
 
464 aa  250  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  34.71 
 
 
469 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  33.19 
 
 
458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  35.62 
 
 
463 aa  239  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  32.68 
 
 
460 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  32.57 
 
 
463 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  34.32 
 
 
456 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  31.28 
 
 
450 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  31.8 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  32.56 
 
 
443 aa  213  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  30.41 
 
 
457 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  30.95 
 
 
471 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  33.01 
 
 
457 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  31.19 
 
 
469 aa  199  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  29.25 
 
 
462 aa  192  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  29.52 
 
 
439 aa  187  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  32.48 
 
 
431 aa  187  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  31.57 
 
 
456 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  29.95 
 
 
439 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  30.68 
 
 
456 aa  176  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  30.54 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  28.3 
 
 
456 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  27.17 
 
 
420 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  28.21 
 
 
487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.7 
 
 
509 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  28.89 
 
 
476 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  27.38 
 
 
472 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  27.77 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  30.29 
 
 
454 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  24.94 
 
 
485 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  26.9 
 
 
475 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  26.15 
 
 
472 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  27.05 
 
 
501 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.6 
 
 
474 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  26.02 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  27.08 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  24.88 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  25.35 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  37.38 
 
 
105 aa  67.4  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  26.23 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  26.78 
 
 
365 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  27.66 
 
 
356 aa  54.3  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>