More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4455 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  98.82 
 
 
85 aa  162  2e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  96.47 
 
 
85 aa  159  8e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  96.47 
 
 
85 aa  158  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 
89 aa  119  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  68.24 
 
 
89 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  55.29 
 
 
87 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  54.12 
 
 
87 aa  79.7  1e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  54.22 
 
 
88 aa  79.3  2e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  52.94 
 
 
86 aa  78.6  3e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.07001e-09  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
87 aa  77.4  6e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
87 aa  77.4  6e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 
91 aa  77.4  6e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  5.03412e-05 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
86 aa  76.6  1e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  55.29 
 
 
88 aa  75.9  2e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.03326e-06  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
92 aa  75.9  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  51.19 
 
 
86 aa  74.7  4e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 
92 aa  74.3  5e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
88 aa  73.9  7e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 
91 aa  73.9  7e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
88 aa  73.6  8e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.08096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
88 aa  73.6  8e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
88 aa  73.6  8e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.04572e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
88 aa  73.6  8e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.94185e-06  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
87 aa  73.6  9e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.49993e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
87 aa  73.6  9e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  5.79115e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
87 aa  73.6  9e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.29038e-06  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
88 aa  73.2  1e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.53205e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  49.41 
 
 
95 aa  73.2  1e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
88 aa  72.8  1e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  7.00681e-09  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  49.37 
 
 
88 aa  72.8  1e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 
87 aa  72  2e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.43906e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
88 aa  72.8  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45.24 
 
 
87 aa  72  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 
88 aa  72.4  2e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
88 aa  72  2e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
88 aa  72  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
88 aa  71.6  3e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.11095e-08  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.05 
 
 
88 aa  72  3e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  50 
 
 
85 aa  71.6  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  50.63 
 
 
88 aa  71.6  3e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
88 aa  71.6  3e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.0022e-08  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
88 aa  71.6  3e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.22066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
88 aa  71.6  4e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  48.24 
 
 
88 aa  71.2  5e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 
90 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 
107 aa  70.5  7e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  48.81 
 
 
87 aa  70.1  9e-12  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  45.88 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
92 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  45.88 
 
 
115 aa  69.3  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  5.62255e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.3085e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.78838e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 
90 aa  69.3  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.59944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.13857e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  54.43 
 
 
86 aa  69.3  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.73203e-15  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.4189e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 
88 aa  69.3  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.06786e-06  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.55802e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.13778e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.1535e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 
89 aa  68.2  3e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
86 aa  68.6  3e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
87 aa  68.6  3e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 
86 aa  67.8  4e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
86 aa  68.2  4e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
99 aa  67.8  5e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  8.72417e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  9.0572e-06  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  49.41 
 
 
86 aa  67.8  5e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.42728e-06  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.61385e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.98649e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 
86 aa  67.4  6e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 
87 aa  67  7e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  44.71 
 
 
87 aa  67  7e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  9.15309e-07 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 
78 aa  67  8e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.16553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 
77 aa  66.6  1e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  48.1 
 
 
89 aa  66.6  1e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 
87 aa  66.6  1e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.60392e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  47.06 
 
 
87 aa  66.2  1e-10  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 
91 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>