More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7609 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  76.47 
 
 
255 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  77.65 
 
 
255 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.9 
 
 
255 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  72.94 
 
 
255 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  72.16 
 
 
255 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  72.05 
 
 
255 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.57 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.78 
 
 
256 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.8 
 
 
256 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.17 
 
 
256 aa  258  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.4 
 
 
256 aa  258  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  48.22 
 
 
256 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 
255 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 
255 aa  251  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  48 
 
 
256 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  47.83 
 
 
255 aa  248  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.79 
 
 
256 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.8 
 
 
256 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.4 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
259 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.4 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  48.4 
 
 
257 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  49.17 
 
 
256 aa  237  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.25 
 
 
258 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.4 
 
 
260 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  44 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.85 
 
 
256 aa  230  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.46 
 
 
259 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.61 
 
 
278 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.46 
 
 
259 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  50.22 
 
 
227 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
254 aa  222  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  43.31 
 
 
255 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  46 
 
 
262 aa  218  8.999999999999998e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.24 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.71 
 
 
271 aa  211  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 
257 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.68 
 
 
242 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.89 
 
 
272 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.25 
 
 
257 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.14 
 
 
257 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.25 
 
 
257 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.73 
 
 
248 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 
258 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.11 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.02 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.4 
 
 
257 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.73 
 
 
252 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.41 
 
 
259 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 
259 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.96 
 
 
246 aa  184  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.79 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.96 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  42.13 
 
 
252 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.34 
 
 
252 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  39.6 
 
 
257 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  40.71 
 
 
252 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  40.45 
 
 
284 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.86 
 
 
259 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.47 
 
 
259 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.42 
 
 
258 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 
259 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.41 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.06 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  43.42 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.92 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.48 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 
266 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 
267 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.02 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.37 
 
 
256 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.06 
 
 
245 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.38 
 
 
259 aa  168  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.769751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.48 
 
 
263 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 
257 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  38 
 
 
250 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  38.74 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  37.55 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.96 
 
 
279 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.96 
 
 
279 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.45 
 
 
257 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06231  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  39.55 
 
 
246 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.13 
 
 
258 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.21 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.59 
 
 
295 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  37.21 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.93 
 
 
268 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
258 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  38.93 
 
 
266 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.59 
 
 
295 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 
263 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.4 
 
 
256 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  42.52 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.36 
 
 
259 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 
257 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.49 
 
 
255 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>