178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6208 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6208  putative phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
293 aa  604  1e-172  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000986716  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  68.73 
 
 
297 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4622  phosphatidylserine decarboxylase  61.19 
 
 
292 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  58.6 
 
 
291 aa  353  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3604  phosphatidylserine decarboxylase  57.5 
 
 
290 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0342  phosphatidylserine decarboxylase  56.49 
 
 
303 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106695  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  34.67 
 
 
289 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  32.62 
 
 
292 aa  137  3e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  32.62 
 
 
292 aa  137  3e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  32.62 
 
 
292 aa  137  3e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  32.62 
 
 
292 aa  137  3e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 
302 aa  135  7e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.13131e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  33.96 
 
 
288 aa  135  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  29.97 
 
 
293 aa  134  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  29.97 
 
 
293 aa  134  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  29.97 
 
 
293 aa  134  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  31.91 
 
 
287 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  32.86 
 
 
293 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  34.07 
 
 
285 aa  133  4e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.22964e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  30.42 
 
 
304 aa  133  4e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  32.5 
 
 
293 aa  133  4e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  34.63 
 
 
286 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  31.91 
 
 
292 aa  132  8e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  31.91 
 
 
292 aa  132  8e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  31.54 
 
 
286 aa  131  1e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  32.58 
 
 
303 aa  131  2e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  32.03 
 
 
289 aa  130  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  31.56 
 
 
292 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  33.95 
 
 
289 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  32.59 
 
 
283 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 
286 aa  129  7e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  30.18 
 
 
285 aa  129  7e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  33.46 
 
 
284 aa  129  8e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 
283 aa  129  8e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 
288 aa  128  1e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 
288 aa  127  2e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 
282 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
287 aa  127  2e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  30.55 
 
 
304 aa  127  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  33.71 
 
 
283 aa  127  2e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  32.71 
 
 
282 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  32.29 
 
 
287 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  28.93 
 
 
285 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 
322 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 
322 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 
322 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 
322 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  32.33 
 
 
282 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 
322 aa  125  8e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 
287 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
322 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0749  phosphatidylserine decarboxylase  35.36 
 
 
295 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
322 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
322 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.17081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
322 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.36154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  28.88 
 
 
322 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 
316 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  6.39801e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
322 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
322 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.43358e-07  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 
322 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
322 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.65826e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 
287 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 
287 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  32.06 
 
 
307 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  31.39 
 
 
277 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  33.86 
 
 
282 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  33.86 
 
 
282 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 
287 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  31.69 
 
 
286 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  31.23 
 
 
284 aa  121  1e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  32.08 
 
 
287 aa  121  1e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
345 aa  121  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  2.48623e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  28.42 
 
 
342 aa  121  1e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  32.93 
 
 
277 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  30.4 
 
 
325 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.86 
 
 
610 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  31.77 
 
 
286 aa  119  4e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  34.09 
 
 
303 aa  119  5e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 
293 aa  119  5e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 
283 aa  119  8e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 
285 aa  118  1e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  30.14 
 
 
613 aa  118  1e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  32.79 
 
 
273 aa  118  1e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
262 aa  117  2e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
262 aa  117  2e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  32.73 
 
 
283 aa  118  2e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
262 aa  117  2e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
262 aa  118  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 
262 aa  118  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  28.92 
 
 
318 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1554  phosphatidylserine decarboxylase  35.65 
 
 
266 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  34.84 
 
 
294 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  32.95 
 
 
286 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  29.57 
 
 
262 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  31.15 
 
 
286 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  29.54 
 
 
254 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
262 aa  115  8e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
262 aa  115  9e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  31.37 
 
 
289 aa  115  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 
286 aa  115  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>