216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4178 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4178  esterase  100 
 
 		 255 aa  510  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  66.12 
 
 		 214 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  67.42 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  63.04 
 
 		 213 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  61.83 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  60.43 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  61.29 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.51 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  59.34 
 
 		 227 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  55.68 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  56.08 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  52.43 
 
 		 210 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.06 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  56.18 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  56.04 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  53.89 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  52.88 
 
 		 202 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  54.44 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  54.44 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  49.75 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 		 204 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  51.65 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  54.86 
 
 		 214 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  51.69 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  51.96 
 
 		 198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  48.9 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  50.87 
 
 		 201 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  48.56 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  46.15 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  45.36 
 
 		 216 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  43.33 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.02 
 
 		 237 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  47.06 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.78 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  41.92 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  43.35 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.69 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  41.04 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.75 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  42.41 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  42.71 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  41.88 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  41.04 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  42.54 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  34.73 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.62 
 
 		 202 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.67 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  41.3 
 
 		 202 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  38.95 
 
 		 222 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  39.66 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  39.66 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.66 
 
 		 184 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  38.25 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  38.25 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  39.11 
 
 		 225 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  43.12 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  39.11 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  38.55 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  35.71 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  41.28 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  41.62 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  37.84 
 
 		 212 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  38.86 
 
 		 209 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  38.05 
 
 		 215 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  41.34 
 
 		 204 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  40.7 
 
 		 201 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  39.43 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  40.46 
 
 		 209 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  34.27 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  38.15 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  38.07 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  36.32 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  38.86 
 
 		 201 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  40.45 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  38.86 
 
 		 201 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.4 
 
 		 270 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  39.62 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  39.53 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  38.67 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  38.86 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  40.83 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  40.23 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  35.2 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  39.39 
 
 		 200 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  32.57 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  37.71 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  39.31 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  40 
 
 		 200 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  36.47 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  35.87 
 
 		 213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  37.5 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  34.64 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  34.64 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.07 
 
 		 190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  34.64 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  35.35 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.07 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  34.64 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  34.64 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  34.64 
 
 		 226 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>