More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3976 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  88.64 
 
 		 137 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  88.64 
 
 		 142 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  84.85 
 
 		 137 aa  239  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  82.58 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  82.22 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  81.06 
 
 		 138 aa  229  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  81.06 
 
 		 138 aa  229  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  76.15 
 
 		 132 aa  207  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  76.15 
 
 		 132 aa  207  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  75.38 
 
 		 138 aa  204  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  70.9 
 
 		 136 aa  202  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  74.62 
 
 		 132 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  76.15 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  72.31 
 
 		 133 aa  199  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  72.66 
 
 		 128 aa  199  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  78.33 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  72.66 
 
 		 129 aa  198  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  79.49 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  70.77 
 
 		 132 aa  195  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  70 
 
 		 132 aa  193  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  70.77 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  67.69 
 
 		 133 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  77.78 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  70.99 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  77.78 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  71.07 
 
 		 136 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  66.92 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  68.46 
 
 		 133 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  74.17 
 
 		 135 aa  186  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  67.69 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  67.69 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  66.92 
 
 		 347 aa  184  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  71.79 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  65.38 
 
 		 334 aa  176  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  66.67 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  56.82 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  59.69 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 		 153 aa  123  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.84 
 
 		 318 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  47.5 
 
 		 313 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  46.67 
 
 		 315 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  46.67 
 
 		 315 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  45.24 
 
 		 314 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 		 316 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  44.26 
 
 		 314 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  45.24 
 
 		 317 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  40.65 
 
 		 321 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  43.44 
 
 		 314 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  43.44 
 
 		 314 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  40.6 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  47.86 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  42.48 
 
 		 306 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  40.6 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  43.44 
 
 		 314 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  45 
 
 		 313 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  46.61 
 
 		 302 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40.83 
 
 		 316 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.83 
 
 		 314 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  40.6 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  40.91 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  44.17 
 
 		 329 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  44.17 
 
 		 329 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  45 
 
 		 312 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  40.91 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  40.46 
 
 		 400 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  44.62 
 
 		 320 aa  97.1  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  40.15 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.15 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.06 
 
 		 310 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.1 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.52 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  44.62 
 
 		 320 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 		 360 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  40.77 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  41.73 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>