More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0002 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  55.44 
 
 
202 aa  208  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  51.76 
 
 
199 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  49.75 
 
 
199 aa  197  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  52.28 
 
 
199 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  50.52 
 
 
199 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  50.52 
 
 
199 aa  186  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  49.47 
 
 
202 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  50.25 
 
 
199 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  48.88 
 
 
202 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  46.91 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  51.53 
 
 
182 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  47.98 
 
 
212 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  43.92 
 
 
202 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  46.02 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  48.59 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  45.71 
 
 
212 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  41.49 
 
 
198 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  39.79 
 
 
199 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  42.55 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  44.85 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  44.69 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  42.86 
 
 
197 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  42.86 
 
 
197 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  43.75 
 
 
212 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  42.29 
 
 
197 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  45.76 
 
 
202 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  46.89 
 
 
202 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  45.45 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  39.47 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  41.14 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  42.46 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  45.25 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  37.04 
 
 
198 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  46.59 
 
 
204 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  42.39 
 
 
204 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  41.85 
 
 
204 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  42.86 
 
 
197 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  44.21 
 
 
205 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  34.02 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  33.51 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  46.67 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  36.46 
 
 
195 aa  110  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  35.03 
 
 
197 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  36.6 
 
 
193 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  36.13 
 
 
193 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  35.79 
 
 
194 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  35.79 
 
 
194 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  35.79 
 
 
194 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  35.79 
 
 
194 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  35.26 
 
 
194 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  35.79 
 
 
207 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  31.41 
 
 
191 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  32.98 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  35.6 
 
 
186 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  35.23 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  35.57 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  32.11 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  33.51 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  36.46 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002990  Maf/YceF/YhdE family protein  34.9 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000201354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  35.26 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  34.02 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  34.36 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  35.23 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  33.65 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  34.57 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  35.26 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  35.26 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  32.98 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  29.95 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  29.95 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  33.16 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  29.95 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  35.26 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  35.26 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  35.26 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  29.95 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  35.26 
 
 
194 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  35.26 
 
 
194 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  29.95 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  29.95 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  28.64 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  32.11 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  34.54 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  36.98 
 
 
193 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  33.5 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  29.69 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  33.5 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  36.92 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  29.17 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  33.16 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  34.36 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  32.46 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  34.72 
 
 
194 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  31.31 
 
 
192 aa  92  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  34.72 
 
 
194 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  29.44 
 
 
191 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  33.85 
 
 
198 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  35.57 
 
 
192 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>