49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3791 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3687  cell wall hydrolase/autolysin  77.18 
 
 		 450 aa  749    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3791  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 		 450 aa  914    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0066  cell wall hydrolase/autolysin  45.37 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0488  putative lipoprotein  48.43 
 
 		 201 aa  153  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  41.57 
 
 		 438 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  49.59 
 
 		 1805 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0538  hypothetical protein  47.71 
 
 		 204 aa  117  5e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00554774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  39.38 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  35.37 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  37.01 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  36.43 
 
 		 890 aa  87.4  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  33.57 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0039  hypothetical protein  34.03 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0040  hypothetical protein  34.03 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.03 
 
 		 860 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.32 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  28.87 
 
 		 876 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.49 
 
 		 815 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  31.76 
 
 		 358 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2818  cell wall hydrolase/autolysin  26.32 
 
 		 191 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00466291  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  27.75 
 
 		 268 aa  50.1  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2689  hypothetical protein  32.03 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0430  cell wall hydrolase/autolysin  26.37 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0213  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.66 
 
 		 257 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00242661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  26.94 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  27.39 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.76 
 
 		 907 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1689  cell wall hydrolase/autolysin  21.11 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.147048  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3811  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.32 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145796  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1722  cell wall hydrolase/autolysin  21.11 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3384  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.66 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.18 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3004  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.72 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.695553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0994  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.13 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.367182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3228  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.13 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0709021  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  24 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0920  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.16 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1046  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.13 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0326494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.29 
 
 		 377 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0440  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.32 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000507324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  25.77 
 
 		 627 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1162  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.99 
 
 		 233 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.820741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  22.49 
 
 		 240 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.55 
 
 		 412 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00703451  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  22.89 
 
 		 703 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  25.38 
 
 		 585 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>