More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0641 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  77.01 
 
 
449 aa  701  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2512  hypothetical protein  72.83 
 
 
452 aa  684  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  77.17 
 
 
438 aa  730  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0443  MiaB family RNA modification protein  86.14 
 
 
440 aa  799  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  76.78 
 
 
449 aa  700  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0641  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  906  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  76.26 
 
 
441 aa  724  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  81.51 
 
 
450 aa  760  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  66.51 
 
 
458 aa  623  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  64.79 
 
 
472 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  65.38 
 
 
466 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  61.01 
 
 
462 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01141  Fe-S oxidoreductase  57.53 
 
 
454 aa  540  1e-152  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01181  Fe-S oxidoreductase  56.75 
 
 
454 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.681569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01171  Fe-S oxidoreductase  56.52 
 
 
454 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.72418  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0106  hypothetical protein  56.06 
 
 
471 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  46.45 
 
 
436 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3110  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.7 
 
 
446 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.43108e-05  normal  0.954122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0100  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  47.14 
 
 
469 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0256489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.8 
 
 
444 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.74 
 
 
442 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.336e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0111  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  46.91 
 
 
469 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0093  hypothetical protein  46.45 
 
 
483 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.99 
 
 
450 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.16014e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  43.72 
 
 
455 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  45.52 
 
 
432 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.57 
 
 
447 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  46.22 
 
 
470 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.31 
 
 
449 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.53 
 
 
448 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.54849e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3205  hypothetical protein  42.66 
 
 
445 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.3464e-13  hitchhiker  3.00152e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2498  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.44 
 
 
486 aa  363  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0716  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.86 
 
 
448 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.99844e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.63 
 
 
448 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.30586e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.22 
 
 
453 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.62674e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1671  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.08 
 
 
487 aa  358  1e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.813765  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.04 
 
 
446 aa  357  2e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.58003e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.45 
 
 
442 aa  353  3e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.0077e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  42.32 
 
 
445 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.09 
 
 
445 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0735  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.9 
 
 
463 aa  343  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.92 
 
 
440 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.98883e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0839  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.89 
 
 
450 aa  342  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.14 
 
 
440 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.30864e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2144  hypothetical protein  37.81 
 
 
504 aa  336  6e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3525  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.53 
 
 
444 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0531  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.09 
 
 
472 aa  329  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680198  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1025  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.46 
 
 
433 aa  329  6e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.813856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1262  2-methylthioadenine synthetase  39.86 
 
 
439 aa  328  1e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.467346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1284  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.3 
 
 
482 aa  328  1e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13538  putative Fe-S oxidoreductase  39.06 
 
 
435 aa  327  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5359  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.37 
 
 
437 aa  321  1e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.23 
 
 
444 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.59 
 
 
436 aa  320  4e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3605  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.43 
 
 
436 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.757621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3568  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.95 
 
 
471 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1606  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.91 
 
 
456 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1444  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.61 
 
 
443 aa  318  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1314  hypothetical protein  38.75 
 
 
453 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.95672e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.07 
 
 
437 aa  317  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1464  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.29 
 
 
440 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.64 
 
 
430 aa  315  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.36513e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.22 
 
 
442 aa  315  1e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.72 
 
 
430 aa  314  2e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0653  2-methylthioadenine synthetase  36.61 
 
 
437 aa  314  2e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.835098  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1585  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.28 
 
 
444 aa  313  4e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678841  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.88 
 
 
453 aa  313  5e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4495  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.98 
 
 
469 aa  313  6e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  5.07978e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1063  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.96 
 
 
458 aa  312  8e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.270511  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40 
 
 
467 aa  312  8e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0770  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.92 
 
 
457 aa  312  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.579434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2510  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.82 
 
 
441 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.04 
 
 
430 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0894  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  310  3e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.917524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0953  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  310  3e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1003  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  310  3e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.902435  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0920  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  310  3e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1782  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.88 
 
 
453 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5082  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.66 
 
 
453 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6297  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.88 
 
 
453 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1488  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.66 
 
 
468 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517417  normal  0.112156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00819  hypothetical protein  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0988  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.479636  normal  0.703934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0906  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0895  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.465773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0862  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.746353  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00802  predicted SAM-dependent methyltransferase  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1722  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.45 
 
 
453 aa  309  6e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2840  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.06 
 
 
441 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0982  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.6 
 
 
441 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2259  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.77 
 
 
463 aa  308  1e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.43 
 
 
435 aa  308  1e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.038543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1695  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.45 
 
 
453 aa  308  1e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184719  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2811  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.89 
 
 
441 aa  306  5e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1715  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.74 
 
 
531 aa  306  5e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1536  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.51 
 
 
525 aa  306  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0262193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2732  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.28 
 
 
455 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1803  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.92 
 
 
524 aa  305  9e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.6995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>