More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2065 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  100 
 
 
446 aa  908  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  54.65 
 
 
454 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  52.01 
 
 
457 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  53.85 
 
 
457 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  53.78 
 
 
454 aa  471  1e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  54 
 
 
453 aa  469  1e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  53.41 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  52.86 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  53.3 
 
 
458 aa  471  1e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 
458 aa  470  1e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  52.4 
 
 
458 aa  468  1e-130  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  52.4 
 
 
458 aa  468  1e-130  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  53.22 
 
 
457 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 
449 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 
449 aa  459  1e-128  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  51 
 
 
454 aa  458  1e-128  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  52.32 
 
 
484 aa  459  1e-128  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  51 
 
 
454 aa  458  1e-128  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  49.11 
 
 
460 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  51 
 
 
457 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 
453 aa  454  1e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 
450 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  49.11 
 
 
450 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  51.43 
 
 
470 aa  443  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 
453 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  49.44 
 
 
452 aa  441  1e-122  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 
448 aa  439  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  51.99 
 
 
457 aa  439  1e-122  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 
459 aa  441  1e-122  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  49 
 
 
489 aa  441  1e-122  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  51.45 
 
 
449 aa  440  1e-122  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50 
 
 
451 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.21912e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  47.65 
 
 
453 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  47.38 
 
 
457 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  52.66 
 
 
415 aa  423  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  46.81 
 
 
452 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 
462 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  47.84 
 
 
520 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  49.54 
 
 
463 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 
458 aa  417  1e-115  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  46.81 
 
 
461 aa  416  1e-115  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  53.2 
 
 
408 aa  416  1e-115  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.78 
 
 
445 aa  416  1e-115  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 
466 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 
453 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 
453 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 
448 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  48.13 
 
 
465 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  47.88 
 
 
476 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  47.34 
 
 
467 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 
462 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  47.45 
 
 
450 aa  409  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 
452 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  47.46 
 
 
457 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 
514 aa  406  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  46.47 
 
 
517 aa  407  1e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  46.77 
 
 
507 aa  407  1e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  46.22 
 
 
518 aa  407  1e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  49.76 
 
 
452 aa  406  1e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  47.63 
 
 
456 aa  405  1e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  49.76 
 
 
452 aa  406  1e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  44.54 
 
 
514 aa  406  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 
451 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.62714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 
467 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 
467 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  48.26 
 
 
464 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 
478 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 
471 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  47.43 
 
 
477 aa  400  1e-110  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 
466 aa  401  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 
453 aa  400  1e-110  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  47.58 
 
 
477 aa  400  1e-110  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 
462 aa  400  1e-110  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  47.12 
 
 
454 aa  400  1e-110  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 
462 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 
462 aa  399  1e-110  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 
459 aa  399  1e-110  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 
450 aa  400  1e-110  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  45.18 
 
 
459 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  46.83 
 
 
450 aa  397  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  45.13 
 
 
465 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  47.59 
 
 
466 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  49.05 
 
 
464 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 
447 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  48.5 
 
 
452 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 
481 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 
476 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  48.5 
 
 
452 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  47.67 
 
 
456 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 
446 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  47.31 
 
 
465 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  48.58 
 
 
457 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 
476 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  47.61 
 
 
443 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 
446 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>