37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1660 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  43.51 
 
 
352 aa  121  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  46.03 
 
 
136 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  35.5 
 
 
392 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  41.01 
 
 
341 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  38.06 
 
 
354 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  41.13 
 
 
349 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  43.06 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  41.79 
 
 
351 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  40.74 
 
 
351 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  42.45 
 
 
362 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  42.19 
 
 
353 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  44.92 
 
 
331 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  40.71 
 
 
362 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  38.3 
 
 
150 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  45.53 
 
 
360 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  38.06 
 
 
345 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  40.14 
 
 
346 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  41.98 
 
 
355 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  45 
 
 
357 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  41.54 
 
 
345 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  38.81 
 
 
353 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  33.88 
 
 
393 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  42.52 
 
 
397 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  27.52 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  26.87 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  26.05 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  28.69 
 
 
162 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  26.32 
 
 
167 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  23.35 
 
 
179 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  27.74 
 
 
159 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  23.53 
 
 
152 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  25.17 
 
 
168 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  24.49 
 
 
168 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  26.85 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  25.36 
 
 
165 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  29.9 
 
 
120 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>