More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1620 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  100 
 
 		 493 aa  984    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  50.3 
 
 		 494 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  49.9 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.9 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.9 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 494 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  50.2 
 
 		 496 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.7 
 
 		 494 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.49 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  49.29 
 
 		 496 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  48.28 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.45 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 		 461 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  47.97 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.63 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.63 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  47.24 
 
 		 495 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.8 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  43.29 
 
 		 500 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  41.92 
 
 		 507 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  46.33 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.6 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.72 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.72 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 507 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.38 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  41.72 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  45.21 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.58 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.57 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.79 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.72 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.72 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  43.58 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.38 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  44.9 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.67 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  46.26 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  44.26 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.18 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.89 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.18 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.11 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.8 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.18 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.29 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  40.12 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.24 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  40.12 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.8 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  42.36 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.02 
 
 		 523 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  42.01 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.43 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  44.11 
 
 		 500 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.46 
 
 		 524 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  43.56 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.84 
 
 		 503 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.46 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.03 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  45.22 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.1 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.31 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.33 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  42.83 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.31 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.85 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.7 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.49 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.86 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.73 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  39.47 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.29 
 
 		 520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.53 
 
 		 517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  43.55 
 
 		 524 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  38.92 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.14 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.47 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.24 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 504 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.82 
 
 		 516 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  41.75 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>