56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1806 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  75.11 
 
 
241 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  75.11 
 
 
241 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  75.11 
 
 
241 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  37.21 
 
 
236 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  35 
 
 
566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  33.63 
 
 
571 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  34.09 
 
 
566 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  32.02 
 
 
577 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  34.56 
 
 
658 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  34.45 
 
 
688 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  30.77 
 
 
689 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  34.08 
 
 
670 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  31.11 
 
 
615 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  31.11 
 
 
757 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  31.12 
 
 
729 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  30.49 
 
 
662 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  31.44 
 
 
618 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  32.88 
 
 
655 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  32.16 
 
 
616 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  32.16 
 
 
616 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  31.3 
 
 
688 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  29.57 
 
 
619 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  31.3 
 
 
618 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1090  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.87 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.36319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.77 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.86 
 
 
208 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.31 
 
 
213 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  26.79 
 
 
211 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.12 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0660  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.32 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0549126  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.17 
 
 
235 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.07 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.07 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.07 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.07 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3047  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.68 
 
 
211 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.02 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.23 
 
 
204 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.23 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1284  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.66 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.43156  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3327  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.29 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2827  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.33 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501112  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  25 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  26.26 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.35 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.22 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.87 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  22.39 
 
 
221 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>