More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0319 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  100 
 
 
337 aa  647  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  77.12 
 
 
323 aa  467  1e-130  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  79.31 
 
 
323 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  78.68 
 
 
323 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  56.7 
 
 
327 aa  312  5e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.06 
 
 
334 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.12 
 
 
330 aa  288  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
329 aa  285  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
492 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  46.84 
 
 
373 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.46 
 
 
331 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
498 aa  276  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  47.97 
 
 
311 aa  271  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.57577e-07  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
535 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
490 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
478 aa  266  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  47.24 
 
 
338 aa  265  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
482 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  44.38 
 
 
546 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
494 aa  259  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
485 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
488 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  50.79 
 
 
316 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  46.46 
 
 
518 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
485 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
481 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
477 aa  254  2e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
468 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.87 
 
 
313 aa  253  4e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
504 aa  252  5e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
485 aa  253  5e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  51.45 
 
 
278 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  41.38 
 
 
495 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
488 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
464 aa  244  1e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
488 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
469 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
472 aa  243  4e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.47292e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
318 aa  241  9e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
473 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
508 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
482 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
469 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.48 
 
 
294 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
471 aa  239  6e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  239  6e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  239  6e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
490 aa  239  7e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
317 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
475 aa  235  8e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
486 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
484 aa  235  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
484 aa  234  2e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
495 aa  234  2e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
485 aa  234  2e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.2897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  49.51 
 
 
319 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
491 aa  233  4e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.69227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
472 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
485 aa  232  7e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.36948e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
485 aa  232  8e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.72568e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
485 aa  232  8e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.68632e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
485 aa  232  8e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  4.57939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
485 aa  232  8e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.96162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
485 aa  232  8e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  9.37191e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
491 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
491 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  52.55 
 
 
314 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
484 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
484 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
487 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
469 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
480 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
491 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.14653e-06  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.26 
 
 
303 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  3.45941e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
490 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
501 aa  228  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
477 aa  228  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
471 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
492 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
485 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.67432e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
466 aa  226  5e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
479 aa  225  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
463 aa  225  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  42.24 
 
 
588 aa  225  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
468 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
467 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
467 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
469 aa  223  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
505 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  48.72 
 
 
311 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
496 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
473 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
484 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
468 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
492 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
480 aa  223  5e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57984  glutamyl-tRNA synthetase, mitochondrial  37.65 
 
 
491 aa  223  5e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.604011  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
494 aa  223  5e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
466 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
466 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>