More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4094 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 378 aa  752    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  56.96 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  60.05 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  56.12 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  57.91 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  56.88 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  50.77 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  54.97 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  54.83 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  53.48 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  54.59 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  51.66 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  54.29 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  51.03 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  53.53 
 
 		 418 aa  362  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  46.23 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  51.61 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  51.76 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  52.55 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  48.37 
 
 		 387 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  45.62 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  44.83 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  40.16 
 
 		 385 aa  316  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  40.32 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  39.42 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  42.2 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  45.05 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  38.71 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  39.2 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  38.01 
 
 		 393 aa  274  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  39.59 
 
 		 388 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  43.48 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  41.35 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  39.89 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  39.34 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  39.15 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  34.74 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  34.68 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  34.22 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  34.41 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.75 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  34.75 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  37.7 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 386 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 		 376 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  35.93 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  37.03 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  37.5 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32.78 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  34.05 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.47 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  33.33 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  34.37 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  34.52 
 
 		 367 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  35.06 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 388 aa  166  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  38.51 
 
 		 393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  33.15 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  37.87 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  33.24 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.97 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  35.97 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 392 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  35.67 
 
 		 385 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>