103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2770 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 632 aa  1211    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  45.53 
 
 		 651 aa  505  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  48.35 
 
 		 687 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.79 
 
 		 675 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  45.74 
 
 		 665 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  45.74 
 
 		 665 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  45.74 
 
 		 665 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  48.96 
 
 		 676 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  47.83 
 
 		 672 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  42.02 
 
 		 686 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  38.38 
 
 		 681 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  52.29 
 
 		 661 aa  340  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  39.39 
 
 		 664 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  38.72 
 
 		 692 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  38.47 
 
 		 678 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  33.64 
 
 		 718 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.5 
 
 		 731 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  36.54 
 
 		 752 aa  303  8.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  33.13 
 
 		 718 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  38.22 
 
 		 642 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  35.86 
 
 		 691 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  36.78 
 
 		 646 aa  296  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  36.96 
 
 		 651 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  37.2 
 
 		 641 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  37.2 
 
 		 641 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  36.8 
 
 		 679 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  35.88 
 
 		 697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  35.96 
 
 		 708 aa  283  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  35.96 
 
 		 637 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  36.55 
 
 		 739 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.36 
 
 		 654 aa  270  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  34.29 
 
 		 631 aa  265  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  38.1 
 
 		 708 aa  264  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  41.65 
 
 		 671 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  45.87 
 
 		 719 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.1 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  32.97 
 
 		 687 aa  254  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  44.96 
 
 		 736 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.45 
 
 		 683 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  41.6 
 
 		 711 aa  234  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  33.05 
 
 		 671 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.33 
 
 		 319 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  38.97 
 
 		 310 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  38.83 
 
 		 328 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  42.96 
 
 		 319 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  38.32 
 
 		 322 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  36.96 
 
 		 322 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  36.04 
 
 		 331 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  36.04 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  37.1 
 
 		 308 aa  163  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  36.75 
 
 		 326 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  36.75 
 
 		 331 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  34.96 
 
 		 322 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  35.02 
 
 		 651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.8 
 
 		 307 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  29.21 
 
 		 387 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  28.93 
 
 		 653 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.68 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  31.84 
 
 		 394 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  35.2 
 
 		 254 aa  97.1  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  30.03 
 
 		 354 aa  96.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  33.74 
 
 		 273 aa  90.5  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.71 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  22.66 
 
 		 277 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  22.66 
 
 		 277 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  22.66 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  22.27 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  21.48 
 
 		 265 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  21.88 
 
 		 274 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  27.21 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  29.68 
 
 		 322 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  27.66 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  31.2 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25.26 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.61 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.97 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  29.15 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  25.53 
 
 		 294 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  39.39 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  23.66 
 
 		 264 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28 
 
 		 300 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.61 
 
 		 246 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.06 
 
 		 343 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.99 
 
 		 604 aa  50.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  22.18 
 
 		 307 aa  50.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  50.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  25.79 
 
 		 280 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.64 
 
 		 309 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  29.67 
 
 		 266 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  26.33 
 
 		 274 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  26.41 
 
 		 270 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.42 
 
 		 291 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  24.67 
 
 		 327 aa  47.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>