More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1974 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 260 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 281 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.73 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.86 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  40.89 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  37.12 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  41.95 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  35.16 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.81 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.3 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.2 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  36.12 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  36.7 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  45.58 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  40.69 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  40.69 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  40.69 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  40.69 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  40.69 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  40 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  30.48 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  38.12 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  39.55 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.87 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  32.74 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.57 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.38 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.01 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  36.84 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  26.24 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.76 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25.71 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25.71 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25.71 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.66 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.54 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  25.53 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  25.53 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.66 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.71 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  34.32 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  40.16 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  41 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  38.94 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  41 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0892786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>