39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0437 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 503 aa  975    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  42.99 
 
 		 623 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  32.61 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  30.36 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  29.07 
 
 		 634 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  27.06 
 
 		 773 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  26.84 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  28.8 
 
 		 623 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  32.3 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  28.71 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  31.29 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 621 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  31.83 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  24.51 
 
 		 708 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  24.32 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  29.69 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  31.37 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  28.81 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  28.4 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2298  peptidase M48, Ste24p  38.1 
 
 		 420 aa  57  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2984  peptidase M48, Ste24p  31.35 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  35.14 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1185  peptidase M48, Ste24p  36.63 
 
 		 228 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126393  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2649  putative Zn-dependent protease  34.23 
 
 		 228 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1306  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 		 228 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.278651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  29.17 
 
 		 287 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  24.19 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  23.95 
 
 		 339 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1446  heat shock protein HtpX  25.73 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.501086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3844  heat shock protein HtpX  25.73 
 
 		 295 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00537908  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  22.44 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1871  heat shock protein HtpX  25.73 
 
 		 295 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 		 723 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15400  heat shock protein HtpX  25 
 
 		 289 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1480  heat shock protein HtpX  25.73 
 
 		 295 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2325  heat shock protein HtpX  25.69 
 
 		 291 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27480  heat shock protein HtpX  25.69 
 
 		 291 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.538581  normal  0.110611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>