37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0737 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  95.56 
 
 
407 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  833    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  96.11 
 
 
408 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  63.83 
 
 
394 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  32.14 
 
 
359 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  33.43 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  30.03 
 
 
376 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  29.14 
 
 
378 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  29.91 
 
 
367 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  27.4 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  29.33 
 
 
364 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  27.68 
 
 
386 aa  89.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  28.08 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  25.66 
 
 
374 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  28.02 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  27 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  30.77 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  26.51 
 
 
388 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  25.85 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  30.51 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  31.32 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  28.57 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  25.72 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  29.94 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  27.4 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  29.55 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  25.22 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  26.25 
 
 
378 aa  63.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  25 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  29.41 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  26.61 
 
 
379 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  23.21 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  23.31 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  24.86 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  23.47 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  24.49 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.71 
 
 
553 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>