More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0051 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  64.2 
 
 		 544 aa  685    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  61.63 
 
 		 536 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  59.63 
 
 		 542 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  57.2 
 
 		 533 aa  642    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  63.21 
 
 		 535 aa  703    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  61.62 
 
 		 552 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  61.06 
 
 		 652 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  70.89 
 
 		 533 aa  787    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  63.96 
 
 		 535 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  61.89 
 
 		 534 aa  685    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  65.49 
 
 		 542 aa  737    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  56.98 
 
 		 534 aa  646    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  61.13 
 
 		 534 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  64.72 
 
 		 537 aa  718    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  63.96 
 
 		 535 aa  718    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  63.77 
 
 		 535 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  61.16 
 
 		 534 aa  681    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  63.77 
 
 		 535 aa  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  60.98 
 
 		 536 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  59.26 
 
 		 542 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  60.88 
 
 		 536 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  65.22 
 
 		 534 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  58.47 
 
 		 542 aa  665    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  64.65 
 
 		 547 aa  710    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  60.82 
 
 		 581 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  61.74 
 
 		 555 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  61.07 
 
 		 546 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  64.72 
 
 		 545 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  59.81 
 
 		 555 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  62.45 
 
 		 550 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  59.07 
 
 		 543 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  60.9 
 
 		 534 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  61.02 
 
 		 555 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  64.2 
 
 		 549 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  63.21 
 
 		 536 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  64.02 
 
 		 549 aa  686    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  61.24 
 
 		 538 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  61.52 
 
 		 548 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  59.67 
 
 		 543 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  63.96 
 
 		 535 aa  718    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  60.61 
 
 		 536 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  63.52 
 
 		 546 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  59.63 
 
 		 542 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  70.11 
 
 		 537 aa  765    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  61.91 
 
 		 533 aa  701    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  61.02 
 
 		 555 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  60.81 
 
 		 608 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  59.85 
 
 		 536 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  61.35 
 
 		 533 aa  695    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  59.78 
 
 		 542 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  61.37 
 
 		 555 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  60.61 
 
 		 536 aa  671    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  63.89 
 
 		 558 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  64.53 
 
 		 535 aa  729    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  70.78 
 
 		 540 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  61.77 
 
 		 558 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  61.06 
 
 		 550 aa  686    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  63.58 
 
 		 535 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  60.19 
 
 		 555 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  64.54 
 
 		 551 aa  710    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  63.58 
 
 		 535 aa  716    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  65.97 
 
 		 555 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  63.53 
 
 		 545 aa  698    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  65.15 
 
 		 535 aa  722    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  65.15 
 
 		 535 aa  722    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  63.83 
 
 		 558 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  62.36 
 
 		 571 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  63.58 
 
 		 535 aa  717    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  59.81 
 
 		 555 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  60.22 
 
 		 540 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  63.77 
 
 		 535 aa  716    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  64.65 
 
 		 542 aa  727    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  61.74 
 
 		 555 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  58.64 
 
 		 542 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  61.73 
 
 		 533 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  57.44 
 
 		 544 aa  646    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  56.05 
 
 		 540 aa  637    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  59.47 
 
 		 537 aa  655    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  57.6 
 
 		 534 aa  657    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  58.64 
 
 		 542 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  63.12 
 
 		 557 aa  698    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.31 
 
 		 547 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  59.44 
 
 		 542 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  63.77 
 
 		 535 aa  717    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  60.11 
 
 		 535 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  66.23 
 
 		 532 aa  744    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  59.55 
 
 		 569 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  61.11 
 
 		 553 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  65.97 
 
 		 557 aa  727    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  59.35 
 
 		 534 aa  658    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  59.85 
 
 		 554 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  62.66 
 
 		 533 aa  707    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  59.44 
 
 		 542 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  62.08 
 
 		 547 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.79 
 
 		 543 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  64.58 
 
 		 544 aa  687    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  63.21 
 
 		 536 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  61.44 
 
 		 534 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  69.61 
 
 		 533 aa  773    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  62.45 
 
 		 535 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>