More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2764 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 		 289 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  65.59 
 
 		 287 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  62.99 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1157  formyltetrahydrofolate deformylase  64.06 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  63.08 
 
 		 283 aa  359  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  61.43 
 
 		 284 aa  355  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  61.29 
 
 		 287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  61.65 
 
 		 285 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 		 284 aa  345  5e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  60.93 
 
 		 287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  60.36 
 
 		 287 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  59.29 
 
 		 287 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  57.86 
 
 		 287 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  58.06 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 294 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  54.68 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  56.27 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 282 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 294 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 294 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  55.21 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 301 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 287 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 		 289 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  55.59 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 		 298 aa  295  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 292 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 292 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 		 282 aa  294  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 288 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  54.32 
 
 		 285 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 		 285 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 286 aa  291  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 288 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 307 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 286 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  54.68 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 288 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  54.36 
 
 		 291 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  54.55 
 
 		 294 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  53.6 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 288 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 		 294 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  51.56 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  53.96 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 288 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  54.32 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 294 aa  284  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  50 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  53.93 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>