More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1116 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
434 aa  880    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.29 
 
 
425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  60.1 
 
 
429 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.51 
 
 
426 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.78 
 
 
454 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  58.51 
 
 
427 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  60.23 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  54.63 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  54.03 
 
 
445 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  53.79 
 
 
445 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.79 
 
 
445 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  53.79 
 
 
445 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  54.65 
 
 
449 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  53.79 
 
 
445 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  53.79 
 
 
445 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  53.77 
 
 
445 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  53.77 
 
 
445 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  53.79 
 
 
445 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  53.79 
 
 
445 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  53.79 
 
 
445 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  53.77 
 
 
445 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  53.77 
 
 
445 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  53.77 
 
 
445 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  53.79 
 
 
445 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  53.83 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  53.7 
 
 
450 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  53.83 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  53.83 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  54.78 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  54.55 
 
 
449 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.01 
 
 
446 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.2 
 
 
444 aa  443  1e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  52.16 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  52.16 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  54.39 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  52.15 
 
 
448 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  52.16 
 
 
454 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.92 
 
 
452 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  51.44 
 
 
452 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  51.44 
 
 
458 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53 
 
 
448 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  53.24 
 
 
461 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.77 
 
 
449 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.79 
 
 
474 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  51.68 
 
 
451 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.79 
 
 
474 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.18 
 
 
423 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.56 
 
 
537 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  50.83 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
421 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  49.77 
 
 
433 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  50.12 
 
 
421 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4739  NADH dehydrogenase (quinone)  54.1 
 
 
428 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1330  NADH dehydrogenase (quinone)  54.33 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.88 
 
 
421 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  50.95 
 
 
416 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.55 
 
 
433 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  50.71 
 
 
416 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  50.47 
 
 
416 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1351  NADH dehydrogenase (quinone)  52.46 
 
 
428 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.169855 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.28 
 
 
427 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.28 
 
 
427 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.37 
 
 
447 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29970  NADH dehydrogenase I subunit F  47.9 
 
 
449 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  48.79 
 
 
425 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.11 
 
 
443 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.05 
 
 
434 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  46.52 
 
 
428 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.59 
 
 
440 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.13 
 
 
438 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.39 
 
 
439 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.88 
 
 
444 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.72 
 
 
441 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  46.67 
 
 
445 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.59 
 
 
706 aa  363  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.7 
 
 
446 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.72 
 
 
425 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.63 
 
 
441 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1955  NADH dehydrogenase (quinone)  51.1 
 
 
421 aa  359  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0948172  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.19 
 
 
441 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.19 
 
 
441 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.19 
 
 
441 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.34 
 
 
443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  45.15 
 
 
626 aa  355  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  46.04 
 
 
438 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.32 
 
 
442 aa  355  8.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.56 
 
 
431 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.17 
 
 
439 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.1 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.42 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.42 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.52 
 
 
448 aa  353  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.24 
 
 
444 aa  353  5e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  44.89 
 
 
438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.36 
 
 
448 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.45 
 
 
443 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.88 
 
 
446 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  45.89 
 
 
424 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  43.93 
 
 
428 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  42.55 
 
 
426 aa  350  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>