More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3670 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  58.91 
 
 		 536 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  60.48 
 
 		 536 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  60.04 
 
 		 550 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  60.82 
 
 		 533 aa  660    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  60.82 
 
 		 533 aa  660    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  57.43 
 
 		 552 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  55.84 
 
 		 536 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  58.96 
 
 		 533 aa  645    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  57.38 
 
 		 554 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  55.84 
 
 		 536 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  59.19 
 
 		 553 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  59.14 
 
 		 533 aa  641    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  60.3 
 
 		 535 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  60.85 
 
 		 545 aa  661    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  60.79 
 
 		 540 aa  654    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  61.54 
 
 		 555 aa  686    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  56.46 
 
 		 538 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  61.99 
 
 		 534 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  58 
 
 		 531 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  56.88 
 
 		 555 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  55.8 
 
 		 542 aa  647    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.03 
 
 		 535 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  62.66 
 
 		 555 aa  691    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  60.52 
 
 		 538 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.93 
 
 		 548 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  57.59 
 
 		 543 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.92 
 
 		 546 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  58.32 
 
 		 533 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.29 
 
 		 537 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  62.29 
 
 		 555 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  54.81 
 
 		 608 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  59.25 
 
 		 533 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  59.96 
 
 		 543 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  60.69 
 
 		 546 aa  673    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  56.64 
 
 		 535 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  57.51 
 
 		 534 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  58.86 
 
 		 542 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  59.78 
 
 		 546 aa  663    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  61.77 
 
 		 547 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  58.08 
 
 		 534 aa  635    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  60.22 
 
 		 534 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  57.54 
 
 		 542 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  100 
 
 		 558 aa  1155    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  57.48 
 
 		 555 aa  663    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  59.96 
 
 		 543 aa  643    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.46 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.46 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  58.76 
 
 		 547 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  62.29 
 
 		 555 aa  689    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.57 
 
 		 542 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  57.43 
 
 		 534 aa  665    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  58.8 
 
 		 533 aa  643    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  59.78 
 
 		 557 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.08 
 
 		 547 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  57.92 
 
 		 547 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59.37 
 
 		 541 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  59.78 
 
 		 544 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  57.57 
 
 		 532 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  58.61 
 
 		 531 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  59.89 
 
 		 547 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  56.26 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.89 
 
 		 535 aa  631  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  57.59 
 
 		 545 aa  634  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  57.63 
 
 		 559 aa  634  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  57.31 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  57.67 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  57.17 
 
 		 553 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  57.22 
 
 		 553 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  57.22 
 
 		 570 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  56.49 
 
 		 546 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  57.22 
 
 		 553 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  57.68 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  58.6 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  57.59 
 
 		 546 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  57.22 
 
 		 553 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  55.62 
 
 		 550 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  55.7 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  56.86 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  57.4 
 
 		 553 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  57.04 
 
 		 553 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  60.07 
 
 		 542 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  56.26 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  56.86 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  56.86 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.89 
 
 		 535 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  56.86 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  56.49 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  59.67 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  57.22 
 
 		 553 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  56.44 
 
 		 552 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  57.06 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  56.67 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  55.43 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>