262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0053 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30530  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.601239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1359  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6031  tRNA-Val  94.64 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.54533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0027  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.532393  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0012  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0269943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0064  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0045  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0042  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23769  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0042  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t11  tRNA-Val  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.089356  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0793  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0047  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0022  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796952  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0026  tRNA-Val  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.583187  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0013  tRNA-Val  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0002  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0002  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22367  normal  0.0175054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0002  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0012  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000301607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0003  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411773  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01010  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0021  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t02  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0460294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0058  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000131227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0071  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0054  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0019  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0049  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0053  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0055  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0019  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna086  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000772007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0056  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000109894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0086  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0087  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.456673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0054  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2834  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000118902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6035  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0015496  normal  0.392625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0014  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0002  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0014  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.580851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0010  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.172147  normal  0.574925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>