More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3069 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3273  amino acid permease-associated region  88.68 
 
 		 486 aa  850    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3069  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  970    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1591  amino acid permease-associated region  50.51 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340007  normal  0.272695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3270  amino acid permease-associated region  47.72 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3417  amino acid permease-associated region  44.9 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0873  amino acid permease-associated region  45.04 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  49.03 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1983  amino acid transporter  45.12 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4301  amino acid permease-associated region  47.08 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4065  amino acid permease-associated region  47.08 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3457  amino acid permease-associated region  47.08 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3965  amino acid permease-associated region  45.9 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  45.09 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01410  L-asparagine transporter  47.71 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00425932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2193  amino acid permease-associated region  47.71 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3209  amino acid permease-associated region  44.26 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01421  hypothetical protein  47.71 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00419609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  45.53 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  45.53 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1499  amino acid permease-associated region  45.16 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3458  amino acid permease-associated region  46.44 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.71207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2206  amino acid permease-associated region  47.71 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000670544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  45.53 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2059  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0501349  hitchhiker  0.00455719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1540  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1725  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572369  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6995  amino acid permease-associated region  47.2 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1635  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1718  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2097  amino acid permease-associated region  48.37 
 
 		 498 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6330  amino acid permease-associated region  47.2 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.80372  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1757  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000130352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1699  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000238766  normal  0.347995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1576  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000285451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1702  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 497 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000149033  normal  0.155266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1763  L-asparagine permease  47.71 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0655306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3759  amino acid permease-associated region  48.68 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3977  amino acid permease-associated region  47.95 
 
 		 516 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1554  amino acid permease-associated region  48.46 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3400  amino acid permease-associated region  44.44 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1301  amino acid permease-associated region  47.7 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259093  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0454  amino acid permease-associated region  44.68 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1347  amino acid permease-associated region  46.55 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000251432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1741  amino acid permease-associated region  44.86 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10351  L-asparagine permease ansP2  45.82 
 
 		 487 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3549  amino acid permease-associated region  49.29 
 
 		 504 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12159  L-asparagine permease ansP1  44.49 
 
 		 489 aa  345  8e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0029057  normal  0.731439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20750  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  43.1 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0330328  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  39.86 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4431  amino acid permease-associated region  42.59 
 
 		 495 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5754  amino acid permease-associated region  44.92 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  normal  0.385006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  37.38 
 
 		 462 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  36.6 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  38.92 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  38.89 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  38.89 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  38.89 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  38.21 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  38.55 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  38.55 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  38.55 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  38.55 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  35.76 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  36.77 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  37.62 
 
 		 463 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  38.42 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  34.11 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  35.13 
 
 		 468 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  35.51 
 
 		 469 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  35.29 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  36.78 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  35.31 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  36.78 
 
 		 457 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  36.78 
 
 		 456 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 		 456 aa  281  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  36.11 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  36.78 
 
 		 456 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  36.78 
 
 		 457 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  36.41 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  36.78 
 
 		 456 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.67 
 
 		 463 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  37.68 
 
 		 463 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.67 
 
 		 463 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  36.18 
 
 		 473 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  36.41 
 
 		 447 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  36.41 
 
 		 447 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  36.41 
 
 		 447 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  36.44 
 
 		 456 aa  279  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  36.54 
 
 		 456 aa  279  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  37.6 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.19 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  35.04 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  35.04 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  37.68 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.43 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  37.14 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.43 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  36.17 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  36.63 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>