127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1962 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  88.31 
 
 		 256 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  67.92 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  67.36 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  69.17 
 
 		 243 aa  308  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  66.25 
 
 		 281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  65.29 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  61.25 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  60.42 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  60.08 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  59.75 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  59.75 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  59.75 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  62.2 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  59.17 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  58.68 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  62.24 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  58.58 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  60.25 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  57.92 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  58.09 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  58.85 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  56.63 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  59.34 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  58.51 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  59 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  55.42 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  56.67 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  57.74 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  58.37 
 
 		 279 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  56.4 
 
 		 300 aa  254  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  56.67 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  58.09 
 
 		 273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  52.89 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  53.5 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  56.02 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  48.32 
 
 		 239 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  45.45 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  42.41 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  28.45 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  36.45 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  33.47 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  34.02 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  31.33 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  34.25 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  31.2 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  31.91 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  25.43 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  27.02 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  36.41 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  32.94 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  27.5 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.1 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  27.62 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  24.69 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  32.04 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  26.54 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  29.79 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  28.74 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  29.05 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  30.35 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  29.75 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  30.35 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  28.07 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  35.56 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  30.08 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  30.81 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  34 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  36.53 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  31.93 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  25.97 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  37.5 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  34.43 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  34.43 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  36.07 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  25.13 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  27.86 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0855  DNA repair protein RecO  34.05 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  0.155378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  30.17 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  28.12 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  29.94 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  27.89 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  27.39 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  30.17 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl267  DNA repair/recombination protein  22.22 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  28.26 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1733  putative recombination protein O  28.4 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.615018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0991  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1321  DNA repair protein RecO  20 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  30.54 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  31.86 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>